CNS快讯中国科研团队一新策略让膜蛋
细胞膜蛋白在细胞表面发挥着无数的生物功能,对细胞和生物体的生存至关重要。不出所料,许多人类疾病都与异常的膜蛋白功能有关。事实上,膜蛋白占所有FDA批准的小分子药物目标的60%以上.G蛋白偶联受体(GPCR)超家族作为最大的细胞表面受体,是所有临床药物中~34%的靶点.然而,尽管具有重要意义,抗膜蛋白药物的发现却受到了极大的挑战,这主要是由于其自然栖息地的特殊特性:细胞膜。此外,膜蛋白也很难以一种孤立的形式进行研究,因为它们往往会失去基本的细胞特征,并且可能被失活。事实上,在制药工业中,膜蛋白一直被认为是一种“不可药物”的靶点。
近年来,DNA编码化学文库(DEL)应运而生,成为一种强有力的药物筛选技术。如今,DEL已被世界上几乎所有主要制药行业广泛采用。然而,DEL在询问活细胞上的膜蛋白方面也遇到了很大的困难。近日,中国科研团队就靶向活细胞表面膜蛋白提出新的药物策略。该研究提供了一种针对膜蛋白发现配体分子和抑制剂的有效方法,解决了传统研究中以膜蛋白为靶标进行药物研发的难题。相关论文刊登于《NatureChemistry》。
DNA介导的亲和性标记帮助实现了活细胞表面膜蛋白靶标的特异性标记。
细胞膜就像一个巨大的、复杂的、不可预知的海洋。膜蛋白是海洋中的岩石和岛屿。用DNA标签标记膜蛋白靶标,就像在靶标蛋白上有一座灯塔,引导特异性筛选DNA编码的化学文库,以发现药物。图片来源:香港大学
存在于细胞表面的膜蛋白,具有多种对细胞和生物组织至关重要的生物功能,因此,许多疾病均与膜蛋白功能异常有关。但针对膜蛋白的药物开发仍然面临巨大的挑战,这主要源于细胞膜的特殊结构和性质。此外,膜蛋白难以通过人工表达纯化的方式来研究,这是因为在离开细胞的环境后,膜蛋白会失去重要的生物特质,并可能会因此失去生物活性。实际上,在制药行业中,膜蛋白一直被认为是一种“不可成药”的药物靶标。
研究人员利用先前开发的一种“DNA介导的亲和性标记(DPAL)”方法,克服了靶标蛋白特异性的问题,并利用了基于DNA的探针体系,实现了活细胞表面膜蛋白靶标的特异性标记,采用DNA作为信标,在目标膜蛋白上安装一个“跟踪器”实现筛选靶标特异性。
针对药物筛选中往往需要较高的靶标浓度来促进平衡移动,以捕获高结合力的配体分子,而通常膜蛋白在细胞表面的丰度远远低于所需。为了解决这个问题,该团队采用了一种新的策略,使得靶蛋白的DNA标签与分子库中DNA序列互补,提高了膜蛋白靶标的有效浓度;也就是说,“跟踪器”不仅可以帮助找到靶标,还可以吸引分子库中的化合物聚集在目标周围,完成药物筛选。
科研团队用一个含有万化合物的DEL,对抗癌药物的三个重要靶蛋白:叶酸受体(FR)、碳酸酐酶12(CA-12)及表皮生长因子受体(EGFR)进行了筛选研究。该方法有望更广泛地应用于多种膜蛋白靶标,例如可以对一些经典药物靶蛋白进行研究,如GPCR和离子通道,在活细胞环境中利用DEL来发现新颖的药物先导化合物。
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